O ano letivo de 2021/2022 foi a primeira vez que este estabelecimento de ensino participou neste programa, vindo a distinção asseverar que a Pedro Nunes é uma Escola Amiga do Ambiente e do meio que a rodeia. 

O Eco-Escolas é um programa internacional da “Foundation for Environmental Education”, que é desenvolvido em Portugal desde 1996 pela Associação Bandeira Azul da Europa (ABAE).

O seu principal objetivo é encorajar ações e reconhecer o trabalho de qualidade desenvolvido pelas escolas, no âmbito da Educação Ambiental para a Sustentabilidade. Fornece ainda metodologia, formações, materiais pedagógicos, apoios e enquadramento ao trabalho desenvolvido pela escola.